中国医药导刊 ›› 2021, Vol. 23 ›› Issue (2): 109-119.
杨晶晶1, 曹灿2, 崔瑛2,3, 史银玥2, 楚玉玺2, 巫晓慧2
摘要: 目的:采用网络药理学与分子对接法研究苓甘五味姜辛汤抗新冠肺炎(COVID-19)的作用机制与活性成分。方法:借助TCMSP数据库检索苓甘五味姜辛汤的化学成分及成分作用靶点,通过Swiss Target Prediction数据库剔除可能性为0的靶点。以“coronavirus” “pneumonia” “cough” “fever”为检索词在GeneCards及OMIM数据库中检索疾病相应靶点。通过Uniprot数据库校正药物和疾病靶点名称,取苓甘五味姜辛汤与疾病靶点交集,进而运用Cytoscape 3.7.2软件构建中药-化合物-靶点网络进行可视化,用靶点交集通过STRING数据库构建蛋白互作(PPI)网络,DAVID数据库进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,预测交集靶点作用机制,并进行可视化。将中药-化合物-靶点网络中的化合物与新型冠状病毒(SARS-CoV-2)3CL水解酶和血管紧张素转化酶II(ACE2)进行对接,选取与SARS-CoV-2 3CL水解酶结合能最小的6个化合物作为核心活性成分,做进一步研究。结果:中药-化合物-靶点网络包含了5种中药,67个化合物和靶点141个。PPI网络的关键基因涉及AKT1、MAPK1、MAPK3等,GO功能富集分析得到条目104个,KEGG通路富集分析筛选得到99条信号通路。分子对接结果显示6个核心活性成分甘草异黄烷酮、卡里宾、甘草素L、夏姆比奥纳、光甘草宁、五味子素R,与SARS-CoV-2 3CL水解酶及ACE2的结合能普遍较推荐化药小。结论:苓甘五味姜辛汤中的化合物能通过与SARS-CoV-2 3CL水解酶和ACE2结合作用于AKT1、MAPK1、MAPK3等靶点,调节朊病毒病信号通路、非洲淋巴细胞瘤病毒感染通路、小细胞肺癌信号通路和非小细胞肺癌信号通路等发挥抗COVID-19作用。
中图分类号: